Главная страница, используемая по умолчанию, это пустой мод "home".
На главной выводятся технические блоки, а так-же блоки анонсов из других модов.
Перелинковка работает только для конечных страниц, в разделах с реальными публикациями, содержащими достаточно текстовой информации.
Таковыми являются: Страницы, Новости, Статьи, Каталог товаров, Каталог файлов, Организации, Тендеры.
Нет смысла включать перелинковку для модов: Главная, Контакты, Карта сайта, Пользователи и пр.